孙美琪疑案王思凤是本篇外的第二部系列补充资料片，其中讲述了王爱国的儿子王思凤的故事，玩家可以知道王思凤的经历以及转变，知道他为什么会变成那样，全篇有着十分不错的恐怖氛围以及推理谜题。
| 五级线索 | ||
| 红黑蓝圆珠笔 | 给陈庭军的信 | 我发现了秘密 |
| 湖南文物商店 | 区领导来视察 | 辛夫人化妆盒 |
| 孙国义教唆 | 王思凤指纹 | 朱孝坤盗墓 |
| 双色圆珠笔 | 书中文字 | 学习雷锋 |
| 2B铅笔 | 铁门钥匙 | 求婚戒指 |
| 班级合影 | 提醒事项 | 一份卷子 |
| 教具谜题 | 铅笔涂鸦 | 汉墓古尸 |
| 铅笔指纹 | 隐藏文字 | 三角尺 |
| 造句本 | 天棚尺 | 一摞纸 |
| 黑板檫 | 杯子 | 饭盒 |
| 奖状 | 匕首 | 教具 |
| 粉笔 | 教参 | 直尺 |
| 通知 | 教鞭 | 朋友 |
| 四级线索 | ||
| 被刺伤的假人1 | 被刺伤的假人2 | 被刺伤的假人3 |
| 被刺伤的假人4 | 被刺伤的假人5 | 王思凤的秘密 |
| 古代蜡烛台 | 腐尸杀人 | 奇怪板书 |
| 香烟指纹 | 一口棺材 | 二楼直尺 |
| 红塔山 | 上课铃 | 烟灰缸 |
| 恶作剧 | 纸人头 | 火柴 |
| 假人 | 地铺 | 密信 |
| 三级线索 | ||
| 丰台区桥梁厂 | 湘潭市雨湖区 | 怀化市沅陵县 |
| 通化市二道江 | 一个笔记本 | 崇文区 |
| 武清县 | 宣武区 | 密谈 |
| 小芳 | ||
| 二级线索 | ||
| 射手座贴纸 | 白羊座贴纸 | 巨蟹座贴纸 |
| 陈庭君被杀 | 孙美琪被杀 | |
| 一级线索 | ||
| 真相 | ||
